Nie ustawiasz nigdzie start_bit2 za to dwukrotnie start_bit.

_________________
Dragonus Cracovus: Biomagia

W przerwaniu, gdzie odbierasz ramkę umieść sobie zapalanie LED w jednym miejscu tak zajdziesz gdzie jest problem. Na przykład na początek w takim miejscu:

a jak w porządku to coraz głębiej.
Nie wiem po co w przerwaniu linia:

Tą flagę powinieneś zerować tylko i wyłącznie w pętli głównej programu.

_________________
Dragonus Cracovus: Biomagia

A spróbuj tak:

bo może być tu kwestia priorytetów operacji ważna. Niby && ma niższy priorytet, ale kto wie...

No i czy na pewno mieścisz się czasowo w przerwaniu z obsługą całego kodu.

_________________
40-32:2=4!

A jakie masz taktowanie? Fusebity dobrze ustawione i taktowanie w opcjach?
Dodatkowo to:

proponuję dać do przerwania jako zmienne statyczne:

_________________
Dragonus Cracovus: Biomagia

Podaj konkretną wartość kwarcu jaki masz, bo może czasem wychodzi max_bit poza zakres 2 bajtów. W książce pisało, że dla preskalera 8 jest spoko dla różnych częstotliwości taktowania, a tutaj nie wiem. Na pewno dla 11,0592MHz będzie źle z preskalerem 1.

_________________
Dragonus Cracovus: Biomagia

Witaj, sprawdź co Tobie pokazuje podpowiedź jeżeli najedziesz myszką na F_CPU, ja pomimo że zmieniałem w opcjach z 16MHz na 8 tu mi się nie zmieniło, pomimo Clean Project.
Sprawdź wogóle ile cyklów zegara timera trwa ten impuls z podczerwieni, bo ewidentnie źle wylicza czas tych impulsów, skoro nie wchodzi w ten warunek.

Wygeneruj jakiś syg. znany prostokątny i zmierz go na tym pinie, co Ci wogóle mierzy. Ja tak doszedłem do błędu