Witam,
"Exception has been thrown by the target"
Od 2 dni walczyłem u siebie z tym błędem przy uruchamianiu Atmel Studio 6.x. Jako, że nie udało mi się w sieci znaleźć informacji jak sobie z tym poradzić, trochę się nakombinowałem. Ten post ma za zadanie pomóc następnej ofierze przy w/w komunikacie, aby przejść przez niego w miarę bezboleśnie

.
A więc co pomogło mi w rozwiązaniu problemu:
1. CTRL + ALT + DELETE - zabijamy proces Explorer.exe
2. Plik -> Uruchom... i wpisujemy "cmd"
3. W konsoli wpisujemy "set"
4. Na końcu powinno być np. "windir=C:\Windows" (w przypadku moim - WinXP SP3), jeżeli masz "windir=%SystemRoot%", to wpisz ponownie polecenie: "set windir=C:\Windows".
5. Następnie ponownie Plik -> Uruchom... i wpisujemy "regedit"
6. Przechodzimy do: HKEY_LOCAL_MACHINE/System/CurrentControlSet/Control/Session Manager/Environment i wprowadzamy modyfikację analogicznie.
7. Klikamy Plik -> Uruchom... i wpisujemy "Explorer.exe"
8. Klikamy PPM na ikonkę Atmel Studio i uruchamiamy jako administrator
Na marginesie dodam, że podobnie jak z windir postąpiłem z Path, oraz przeinstalowałem Atmel Studio (z .net) również: uruchom jako administrator (choć nie wiem czy to konieczne).
Warto pamiętać, że dla Windowsa nawet z konta użytkownika, z uprawnieniami admina, nie jest oczywiste, że chcemy uruchomić jako admin

Tyle, mam nadzieję, że komuś się przyda w razie problemu.
Proszę również aby w temacie, nie wypisywać, że lepiej zainstalować Eclipse. Chciałem tu podać rozwiązanie problemu, z którym ja miałem do czynienia i być może inny użytkownik AS będzie je potrzebował.