Wprawdzie są darmowe programy do tego typu symulacji o które pytasz. Stosunkowo prosty i do tego darmowym jest 3d jest Google Sketchup. Na youtube masz filmiki w których prezentowane są jego możliwości.
Jeżeli ma to być coś bardziej zaawansowanego, to trzeba będzie raczej komuś to zlecić, bo wizualizacje o które pytasz nie zawsze udaje się wykonać tylko i wyłaćznie w jednym programie.
Tutaj wykonują animacje 3d - link