Witam,
Czy potencjometry z wyjść analogowych, podłączamy do masy zwykłej czy analogowej?

Co rozumiesz pod pojęciem "masa zwykła"? Należy podłączyć w taki sposób, aby tworzyć jak najkrótszą ścieżkę prądu powrotu ze wbudowanym urządzeniem peryferyjnym.

Ale przecież atmega nie ma WYJŚĆ analogowych...

Czyli z tego wynika że w dzisiejszych czasach zwykłą masą jest masa cyfrowa a masa analogowa to dziwactwo.Eh

Nie wiem czy jest dziwactwem czy nie, ale ja dla pomiarów analogowych robię osobna masę. Przy pomiarach ADC 16 bit odczyty są dużo mniej "skaczace" . Zrobienie osobnej masy nic nie kosztuje. Zależy co tam sobie budujesz i czego oczekujesz. Równie dobrze możesz uśrednić wynik i jesli tobie to wystarczy to czemu nie.